Analiza perturbacji przesunięć chemicznych (CSP) w opracowywaniu nowych leków
Wydajne narzędzie automatyzujące procesowanie danych spektroskopowych typu 2D HSQC (
Heteronuclear Single Quantum Coherence) oraz obliczające wartości stałych dysocjacji K
d dla zestawu pików. Przeprowadzając analizy statystyczne K
d dla pików wielokrotnych można równie wysyłać zmierzone CSP do innych aplikacji (afinimetrów) dla zaawansowanej analizy z użyciem różnych powiązanych modeli.
Możliwości modułu
- Intuicyjny przepływ pracy pozwalający na analizę perturbacji przesunięć chemicznych CSP w sposób interaktywny i w pełni automatyczny
- Automatyczne śledzenie przesunięć pików oraz pomiar CSP, dopasowanie do koncentracji ligandów w celu obliczenia wartości stałych dysocjacji
- Narzędzia przetwarzania i układania widm 2D HSQC. Są one wyświetlane w różnych kolorach
- Korekta automatycznego śledzenia przesunięć pików w zagęszczonych obszarach
- Prosty eksport danych CSP do dalszych analiz
Śledzenie pików
Skumulowane widma HSQC z CSP są automatycznie śledzone i mierzone. Rysunek po lewej pokazuje ruch dwóch przypisanych pików. Okno dialogowe po prawej pokazuje szczegóły jednego ze śledzonych pików "13C-H", w tym stosunek stężeń liganda / białka, zmierzone CSP w dowolnym wymiarze, znormalizowanie CSP i dopasowanie wyników Kd i błędu.
Pomiar i dopasowanie
Zakładka ogólna „Chemical Shift Perturbation” pokazuje listę schematów kolorów dla widm miareczkowania, stężeń białka, stężeń ligandów i stosunku stężenia ligandu do białka. Pokazuje również listę pomiarów CSP i dopasowanie Kd dla wszystkich analizowanych pików, a także średni i standardowy błąd Kd.
W pełni automatyczne analizy
Seria miareczkowań może być określona przez ich umieszczenie po kolei w "pliku miareczkowania". Nazwy ligandów są kodowane w "pliku ligandów". Gdy CSP automatycznie uruchamia analizę, tworzy różne pliki Mnova dla każdego miareczkowania wymienionego w "pliku miareczkowania", a dokumenty Mnova są odpowiednio nazwane nazwami ligandów.