1. 13C/HSQC Molecular Search w Mnova NMR

Funkcja wyszukiwania molekularnego 13C/HSQC została zintegrowana z wtyczką Mnova NMR w celu oceny, czy dany eksperymentalny zestaw danych NMR odpowiada znanemu czy nowemu związkowi. Wykonuje ona wyszukiwanie widmowe w bardzo dużej bazie danych syntetycznych zestawów danych NMR przy użyciu informacji 13C z eksperymentu 1D 13C i/lub HSQC, wraz ze wzorem cząsteczkowym (np. z MS o wysokiej rozdzielczości). Wyszukiwanie zwraca listę potencjalnych kandydatów, uporządkowanych według podobieństwa RMSD 13C do danych eksperymentalnych. Oferuje również bezpośrednie linki do PubChem w celu uzyskania dalszych danych szczegółowych dotyczących cząsteczek. Można też łatwo skopiować najlepsze dopasowanie do dokumentu Mnova w celu szybkiego raportowania.
Aby użyć tego narzędzia, wymagana jest baza danych. Postępuj zgodnie z instrukcjami w Mnova, aby poprosić o dostęp!

Rys. 1. Dialogi wyszukiwania molekularnego 13C/HSQC i wyniki tabeli

2. Algorytm MCR-ALS dla Mnova MSChrom i Advanced Chemometrics

MSChrom zawiera teraz algorytm Multivariate Curve Resolution – Alternating Least Squares (MCR-ALS) celem procesu oceny czystości piku, usprawniając podejmowanie decyzji. Ten nowy tryb, dostępny w opcjach narzędzia Pik Purity, można zastosować do dowolnego kanału chromatograficznego z informacjami widmowymi. Mnova dodatkowo zwiększa tę możliwość, pozwalając na połączenie wielu kanałów chromatograficznych, co poprawia zarówno niezawodność, jak i wydajność.

Rys. 2a. Czystość szczytowa – wyniki MCR uzyskane z różnych kanałów chromatograficznych: UV, MS+ i MS-

To udoskonalenie wprowadzone do wtyczki Advanced Chemometrics to potężne narzędzie, umożliwiające bardziej szczegółową analizę wyników czystości piku z wykorzystaniem kompleksowych danych i wykresów, które przyspieszają podejmowanie decyzji.

Rys. 2b. Czystość szczytowa – wykresy wyników MCR wtyczki Advanced Chemometrics

3. Ulepszenia dopasowania cząsteczek dla MSChrom

Narzędzie Molecule Match Scoring zostało ulepszone dzięki wprowadzeniu nowego ustawienia Mass Purity Threshold w ustawieniach dopasowania cząsteczek MSChrom. Dopasowania o czystości masy poniżej tego progu są ignorowane, co skutecznie eliminuje przypadkowe dopasowania i zapewnia bardziej wiarygodne wyniki. Ponadto do ustawień dopasowania cząsteczek dodano nową opcję progową dla liczby linii w klastrze izotopów do wykorzystania na etapie dopasowania. To ustawienie poprawia niezawodność dopasowania dla danych o niskim stosunku sygnału do szumu lub wysokich progach, co jest powszechne w konfiguracjach z otwartym dostępem.

Rys. 3. Ulepszone ustawienia dopasowania cząsteczek z progami czystości masowej i izotopów

4. Zwiększone możliwości narzędzi do przesiewania wiązania ligandów Screen & Mix Design

W tej wersji wtyczka Screen została zaktualizowana do wersji 2.0, co przyniosło znaczące udoskonalenia. Przeprojektowany interfejs użytkownika zapewnia płynniejsze, bardziej intuicyjne działanie, a nowy Fragment Viewer umożliwia szczegółowe badanie wyników wiązania fragmentów. Ponadto Screen DB – nowa funkcjonalność bazy danych – umożliwia zapisywanie wyników, a także wyszukiwanie, filtrowanie i porównywanie danych wiązania z większą wydajnością. Kluczowe aktualizacje obejmują obsługę 19F Screening przy użyciu listy szczytów jako odniesienia, wykorzystanie mediany lub maksymalnych zmian intensywności szczytów w celu dokładniejszego określenia statusu, wygodną funkcję wznawiania, która umożliwia odzyskiwanie przerwanych lub przerwanych wykonań oraz szybsze prędkości wykonywania.

Rys. 4a. Wyniki ekranu ze zdefiniowanymi obszarami zainteresowania i oknem dialogowym przeglądarki ekranu

Aby usprawnić przepływ pracy przesiewowej, wprowadzono Mix Design, funkcję pomocniczą wtyczki Screen, służącą do projektowania mieszanin związków z minimalnym nakładaniem się sygnałów NMR. Powszechną praktyką jest łączenie 6–10 związków w przypadku eksperymentów 1H lub 20–40 związków w przypadku eksperymentów 19F, aby skrócić zarówno czas pomiaru, jak i ilość wymaganego białka docelowego (a zatem i koszt). Jednak podczas analizy takich danych minimalne nakładanie się szczytów ma kluczowe znaczenie dla dekonwolucji mieszaniny i niezawodnej identyfikacji trafień.

Rys. 4b. Wyniki mieszanki nr 10 i przeglądarki projektów mieszanek

5. Silnik Pythona dla ulepszonych możliwości skryptowania

Mnova 15.1 wprowadza nowy silnik Pythona, aby umożliwić naukowcom korzystanie z tego powszechnie przyjętego języka programowania do wykonywania funkcji Mnova i tworzenia zaprojektowanych przez użytkowników narzędzi dostosowanych do ich przepływów pracy i potrzeb. Dedykowana dokumentacja Pythona zawiera niezbędne szczegóły na temat wszystkich dostępnych modułów Mnova i odpowiadających im klas, umożliwiając użytkownikom bezproblemową interakcję z możliwościami Mnova za pośrednictwem Pythona.

Rys. 5. Analiza multipletowa 1H NMR przy użyciu skryptu Python w programie Mnova

6. Eksport JSON dla LC/GC-MS i struktur chemicznych

Mnova obsługuje teraz eksport danych LC/GC-MS i struktur chemicznych w formacie JSON, tak jak robi to już w przypadku danych NMR. JSON to ustrukturyzowany format tekstowy, który nadaje się do wykorzystania przez wiele aplikacji, a większość języków programowania może bezpośrednio współdziałać z JSON, co czyni go idealnym do przetwarzania danych. W Mnova 15.1 interoperacyjność została ulepszona dzięki możliwości zapisywania danych w formacie niezastrzeżonym, co znacznie ułatwia ich wyodrębnianie i analizowanie.

Rys. 6. Opcje zapisu danych w formacie JSON

7. Tabela statusów zbiorów danych

Ten intuicyjny dashboard pozwala na monitorowanie w czasie rzeczywistym procesowanych zbiorów danych, poprzez prezentowanie każdego zbioru w postaci wiersza tabeli. Tabela pokazuje statusy (Oczekiwanie, Przetwarzanie, Zakończone, Błąd) oraz czas procesowania, z użyciem kolorów pozwalających na łatwą identyfikację wizualną. Użytkownik, po kliknięciu na wiersz tabeli, może otworzyć okno ze danymi szczegółowymi dotyczącymi zbioru danych. Dashboard tren pozwala na zaoszczędzenie czasu na wyszukiwanie potrzebnych danych statusowych w logach Mnova.

Rys. 7. Panel monitorowania stanu zbioru danych

8. Gearbox – nowa aplikacja do wykonywania zadań wsadowych

Gearbox umożliwia użytkownikom uruchamianie wielu eksperymentów w różnych partiach bez konieczności ręcznego ich przesyłania za pośrednictwem interfejsu użytkownika. Zazwyczaj w przypadku Mnova Gears użytkownicy muszą uruchamiać każdą analizę wsadową po zakończeniu poprzedniej. Jednak w przypadku Gearbox konfiguracje eksperymentów lub żądania można zapisać w wyznaczonym folderze, a oprogramowanie automatycznie sekwencyjnie je uruchomi. Ta automatyzacja upraszcza przepływ pracy, umożliwiając skupienie się na innych zadaniach, podczas gdy Gearbox zajmuje się przesyłaniem i wykonywaniem eksperymentów.
Należy pamiętać, że ta funkcja wymaga określonego modelu licencjonowania. Upewnij się, że masz odpowiednie licencje, aby uzyskać do niej dostęp.

Rys. 8. Panel konfiguracji Gearbox

9. Zwiększona wydajność i użyteczność Chrom Reaction Optimization i Affinity Screen

Ta wersja Mnova wprowadza znaczące ulepszenia Chrom Reaction Optimization, usprawniając przepływy pracy i optymalizując analizę danych, aby zapewnić użytkownikom bardziej płynne działanie. Te ulepszenia pozwalają użytkownikom skupić się na analizie, a nie na procesie konfiguracji. Ponadto wersja wprowadza ulepszenia do Affinity Screen, umożliwiając użytkownikom bardziej wydajne sortowanie, wyszukiwanie i przeglądanie ligandów, co wspiera zaawansowaną analizę i zwiększa produktywność badań. Aby uzyskać więcej informacji na temat nowych funkcji w każdej wtyczce, zapoznaj się z pełnym dziennikiem zmian.